Numerose cooperative bolognesi sono coinvolte nell'inchiesta della procura di Milano sugli illeciti della politica, conosciuta come “Mani pulite”.

Per una serie di irregolarità sono indagati anche alcuni esponenti politici, tra i quali il vice-sindaco Franco Degli Esposti, che rassegna le dimissioni. La sua vicenda giudiziaria si risolverà in seguito positivamente.