I ministri Tedesco e Credaro, il sindaco Giuseppe Tanari e il Rettore Vittorio Puntoni firmano una seconda convenzione destinata a dare un volto moderno ed elegante al quartiere universitario. Sarà approvata con la legge n. 335 del 9 aprile 1911.

Il costo complessivo è di oltre 6 milioni di lire, sostenuto per oltre l'80 per cento dagli enti cittadini. Nel progetto redatto dall'ing. Filippo Buriani dell'Ufficio Edilità ed Arte del Comune sono previsti nuovi istituti di Chimica generale, Zoologia, Anatomia comparata, Patologia generale, Igiene, Veterinaria. E' l'idea del quartiere universitario su modello francese.

Il progetto Puntoni-Boriani è considerato anche una operazione di "risanamento": comporta infatti un ampio sventramento tra via Belmeloro, via S.Giacomo e la circonvallazione nei pressi di porta San Vitale. Il Comune ha già acquistato nel 1907 un'area fuori porta per ospitare gli sfrattati.

E' prevista inoltre, in sede periferica, una nuova clinica per le malattie nervose, che sarà edificata a Porta Saragozza.

Nell'area del Sant'Orsola saranno ampliati tra il 1911 e il 1914 gli edifici esistenti, con la costruzione della Clinica medica, ostetrica, ginecologica e della camera mortuaria, attorno alla quale più avanti sorgerà il nuovo Istituto di Anatomia patologica.

Allo scoppio della guerra mondiale saranno completate le sedi di Medicina veterinaria e la Clinica neurologica, che verranno requisite dall'autorità militare e adibite a ospedali territoriali di riserva.

Nel 1922 sarà terminato l'Istituto di Chimica generale, costruito dal Genio Civile su disegno di Edoardo Collamarini.