Nella notte del 1° aprile le truppe austriache si ritirano verso Modena. Il 2 aprile il re di Napoli Gioacchino Murat e Girolamo Bonaparte arrivano a Bologna con le loro truppe, accolti calorosamente dal popolo:

“Fanciulli, uomini maturi, vegliardi, donne d'ogni età, d'ogni condizione, da' balconi, dalle finestre, da dentro i portici, più non potendo con la voce, agitavano i fazzoletti in segno d'approvazione e di amore”.

Al comando del generale Guglielmo Pepe, 4.000 soldati napoletani entrano in città da Porta Maggiore, seguiti dalla loro artiglieria, la attraversano e si incamminano fuori Porta San Felice.

Ai muri viene affisso il Proclama di Rimini, mentre gli ultimi soldati austriaci sono ancora in città. I cittadini sono invitati ad appuntare sui loro abiti la coccarda verde e amaranto.

Alla sera Murat saluta la cittadinanza al teatro del Corso e, prima di ripartire per Modena, ha un colloquio con alcuni eminenti soci del Casino: l'avvocato Pellegrino Rossi, nominato poi - a soli 28 anni - Commissario civile per le Romagne, il principe Astorre Hercolani, scelto come suo Consigliere, il conte Cesare Bianchetti, Alessandro Agucchi, designato Prefetto del Dipartimento del Reno con a fianco Giovanni Contri e Giuseppe Venturoli.

Nei giorni successivi arrivano altre truppe, tra le quali un contingente di 2.000 corazzieri, che scorta la famiglia reale.

Viene instaurato un Governo Italiano, che unisce i dipartimenti del Reno, del Rubicone e del Basso Po, con a capo Pellegrino Rossi (1787-1848) come Commissario generale. E' ordinata la ricostituzione della Guardia Nazionale.

Il 5 aprile un gruppo di alti ufficiali dell'Armata d'Italia invita i congedati ad accorrere alla caserma del Corpus Domini, "comune albergo dei difensori della Nazione", dove è in corso anche la raccolta di tutte le armi.

Il Podestà Giuseppe Eugenio Pozzi chiama i giovani a serrarsi sotto "lo stendardo del liberatore", Gambari e Masi incitano gli studenti, il bibliotecario Scevola si mette alla testa di cento scolari, pronto a combattere "fino al momento che il suolo italico sarà purgato dal lezzo degli stranieri".

Il conte Agucchi esorta la gioventù a unirsi ai prodi che combattono "per la causa più bella: la cacciata degli Austriaci".

Nonostante l'entusiasmo di alcuni intellettuali e di pochi militari nostalgici, solo qualche centinaia di giovani romagnoli e bolognesi sono disposti ad arruolarsi come volontari: tra essi c'è anche il quattordicenne Ugo Bassi, che sarà però scartato per il fisico gracile.

L'armata napoletana di Pepe tenterà di passare il Po a Occhiobello (FE), ma verrà respinta dagli Imperiali e dovrà ripiegare in fretta su Bologna.

Insieme ad essa è un battaglione di ufficiali, denominato "battaglione sacro", raccolto dal capitano Costante Ferrari con avanzi dell'esercito del Regno italico. Un reggimento di circa mille volontari, destinato a sollevare la Toscana, non andrà oltre Loiano.

La campagna di Murat per l'indipendenza d'Italia durerà solo due settimane, tra il 30 marzo e il 13 aprile. Le truppe napoletane saranno sconfitte il 10 aprile sul Po e sul Panaro, il 13 avranno la peggio intorno a Ferrara.

Il cronista Majani, non senza ironia, descriverà così le tre domeniche del Re di Napoli: la prima di indipendenza, la seconda di pendenza, la terza di partenza.